Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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HAPLN4Q86UW8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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