Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATG9BQ674R7 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATG9BQ674R7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms