Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FAM196A-201ENST00000424811 3149 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 TFIP11-203ENST00000407431 2974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ANKRD39Q53RE8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms