Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191 ms