Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TAF1AQ15573 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TAF1AQ15573 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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