Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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SIX1Q15475 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SIX1Q15475 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SIX1Q15475 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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SIX1Q15475 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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SIX1Q15475 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SIX1Q15475 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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