Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PTPRRQ15256 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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PTPRRQ15256 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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