Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF5Q13568 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF5Q13568 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms