Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RBBP4Q09028 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RBBP4Q09028 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP4Q09028 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1623.7 ms