Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
UBE3AQ05086 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UBE3AQ05086 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms