Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PPARDQ03181 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms