Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GCNT1Q02742 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms