Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
COPZ1P61923 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
COPZ1P61923 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms