Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms