Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 GZF1-202ENST00000377051 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CHIC1-202ENST00000373504 6797 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 EGFLAM-204ENST00000397202 2398 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 IL21R-201ENST00000337929 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 INTS13-201ENST00000261191 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 LINC00442-202ENST00000456737 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
TMEM258P61165 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms