Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
FNTAP49354 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
FNTAP49354 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
FNTAP49354 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms