Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NCAPD3P42695 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NCAPD3P42695 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NCAPD3P42695 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NCAPD3P42695 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NCAPD3P42695 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NCAPD3P42695 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NCAPD3P42695 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NCAPD3P42695 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
NCAPD3P42695 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NCAPD3P42695 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NCAPD3P42695 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC27.51■■■□□ 2
NCAPD3P42695 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
NCAPD3P42695 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NCAPD3P42695 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NCAPD3P42695 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms