Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARL1P40616 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARL1P40616 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARL1P40616 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARL1P40616 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ARL1P40616 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARL1P40616 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms