Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNB1P35222 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms