Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
TSPOP30536 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TSPOP30536 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TSPOP30536 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TSPOP30536 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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