Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CD53P19397 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CD53P19397 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD53P19397 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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