Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBL4AP11441 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBL4AP11441 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBL4AP11441 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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UBL4AP11441 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
UBL4AP11441 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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