Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GJB1P08034 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms