Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYNMO15061 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYNMO15061 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYNMO15061 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYNMO15061 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms