Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SOBPA7XYQ1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SOBPA7XYQ1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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