Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HELTA6NFD8 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms