Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PSDA5PKW4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms