Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HMX2A2RU54 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms