Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIN1Q9NXP7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GIN1Q9NXP7 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms