Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
AMBRA1Q9C0C7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms