Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TMEM208Q9BTX3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms