Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
COPS8Q99627 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms