Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LMNTD2Q8IXW0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms