Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APTXQ7Z2E3 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APTXQ7Z2E3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms