Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCBE1Q6UXH8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms