Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FBXO42Q6P3S6 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms