Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms