Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RTL6Q6ICC9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RTL6Q6ICC9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RTL6Q6ICC9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RTL6Q6ICC9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RTL6Q6ICC9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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RTL6Q6ICC9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RTL6Q6ICC9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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RTL6Q6ICC9 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
RTL6Q6ICC9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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