Protein–RNA interactions for Protein: Q5RL73

RBM48, RNA-binding protein 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM48Q5RL73 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBM48Q5RL73 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBM48Q5RL73 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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