Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LRRC23Q53EV4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LRRC23Q53EV4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms