Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TTLL9Q3SXZ7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms