Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DDB1Q16531 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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DDB1Q16531 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DDB1Q16531 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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