Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NCF4Q15080 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NCF4Q15080 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms