Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SMCO1Q147U7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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