Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
EBI3Q14213 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms