Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RASGRF1Q13972 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
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