Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CUL4BQ13620 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CUL4BQ13620 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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