Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPP1R1AQ13522 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms