Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NME3Q13232 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NME3Q13232 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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