Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GPS1Q13098 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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